英国将开展3.5万COVID-19患者的基因测序计划,对新冠病毒研究将具有开创及深远意义

2020-05-22 编辑: 来源:测序中国
近日,英国基因组公司(Genomics England)和GenOMICC联盟联合发起了一项COVID-19患者基因组测序计划,旨在分析英国35,000名COVID-19患者的基因组,以了解个人基因如何影响其对病毒感染的反应。该项目得到了英国国家医疗服务体系(NHS)、英国卫生和社会福利部等机构的支持。

据悉,该研究将招募20,000名目前或以前患有COVID-19的重症监护患者,以及15,000名出现轻度或中度症状感染的患者。研究人员将利用测序数据,了解基因组成对患者是否可能仅出现轻度COVID-19症状或是否会发展为重症并需住院的影响。该研究将集中于受COVID-19严重影响的所有年龄段人群,包括儿童和年轻人。

该计划的最终目的是对在NHS重症监护病房的每一位COVID-19患者进行基因测序。Genomics England临床主任Richard Scott表示:“在与NHS合作招募住院患者的同时,我们也鼓励曾接受过COVID-19重症监护,或已经从较轻的COVID-19症状中康复的人在Genomics England网站进行注册。我们认为这是目前同类研究中规模最大的,并且希望最终的基因组数据能够帮助我们更好地了解与重症COVID-19易感性相关的遗传因素。”

这将是一项艰巨的任务,研究团队希望鼓励尽可能多的患者加入,因为研究结果可能会通过诊断和治疗,对今后的人群或个别患者的疾病管理产生影响。虽然无法预测基因数据会显示什么,但研究团队预计新的遗传学见解可帮助对患者进行分层,以便未来进行COVID-19治疗和疫苗临床试验。同时,这些数据还将为患者护理、监测和药物处方提供信息。

据了解,该项目第一项核心分析将是全基因组关联研究(GWAS),以比较轻度和重度COVID-19患者的基因组。Scott指出:“该研究将寻找可能增加严重疾病风险的基因位点,这与其他已知的危险因素无关。重要的是,分析将在迭代的基础上进行,研究团队将对少数患者的基因组测序进行初步分析,然后随着加入该计划人数的增加进行重复分析。”

Scott预计,这些数据将能够进行广泛的分析,有助于科学家将遗传学与疾病的易感性、严重性和临床试验结果联系起来,帮助确定具有特定基因表达谱患者对某些药物的受益情况。从长远来看,如果我们能够了解基因型是否可以影响疫苗的持续反应,这些基因数据还可以帮助疫苗设计。

英国卫生和社会福利部长Matt Hancock表示:“随着时间的推移,我们对新冠病毒的了解越来越多,了解基因组成如何影响人们对其的反应是相关研究中的一个关键部分。这是一项具有开创性和深远意义的研究,将有助于改善COVID-19患者治疗,并拯救更多的生命。”

据悉,由爱丁堡大学Roslin研究所KennethBaillie博士领导的GenOMICC联盟(Genetics of Mortality in Critical Care) 将领导该测序计划的招募工作,并已从2,000名重症监护COVID-19患者中获得了DNA样本。GenOMICC联盟成立于2016年,旨在对患有严重疾病(主要是流感和其他新型疾病)的患者进行基因组测序,以帮助了解遗传学如何影响疾病的结果和严重程度。在建立测序计划之前, GenOMICC联盟就已开始招募COVID-19患者。

Baillie博士表示:“个人基因组在决定谁会患上像COVID-19这样的疾病方面起着重要作用,了解这些基因将有助于我们选择进行临床试验的治疗方法。GenOMICC正在全国160多个ICU中招募参与者,并得到了危重护理界的大力支持。这项工作是对已有的英国冠状病毒病毒测序计划(COG-UK)的补充。我们很高兴能与Genomics England公司合作,共同解决这一新的复杂疾病。“

此外,35000名COVID-19患者的基因组测序将由Illumina公司完成。Illumina方面表示:“我们与Genomics England公司建立了长期的合作伙伴关系,该测序计划将为研究人员建立一个独特的平台,以了解人类对新冠病毒感染的反应,从而开发新的治疗方法和控制感染扩散的方案。”

目前,除英国外,美国CDC已牵头成立新冠病毒基因组测序联盟,以支持新冠病毒监测和疫情应对。法国方面也正在大力支持相关项目的开展。对此,Scott表示,当前国际合作至关重要,共享和分析有关COVID-19易感性、严重性和临床结果的遗传因素数据,将成为人们的一次奇妙的协作。这对于确保找到可能对患者和人群疾病管理产生影响的遗传因素至关重要。

参考资料:

1. New partnership to sequence human genomes in the fight against coronavirus

https://www.genomicsengland.co.uk/genomics-england-genomicc-nhs-covid-19/

2. U.K. Initiative Aims to Sequence 35,000 COVID-19 Patient Genomes; Link Genetic Makeup with Disease Severity

https://www.genengnews.com/news/u-k-initiative-aims-to-sequence-35000-covid-19-patient-genomes-link-genetic-makeup-with-disease-severity/




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